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Biotin-HPDP,生物素-HODP,生物素-N-[6-(生物素氨基)己基]-3'-(2'-吡啶二硫代)丙酰胺,生物素标记吡啶二硫代

一、化合物基础定义

Biotin-HPDP是一种常用的巯基反应性生物素衍生物,属于功能性生物标记试剂,核心用于生物分子的特异性标记与后续分离纯化。其标准中英文名称及相关标识如下:英文全称N-(6-(Biotinamido)hexyl)-3'-(2'-pyridyldithio)propionamide,中文全称N-(6-(生物素胺)己基)-3-(2-吡啶二硫)丙酰胺,常用别名包括生物素-二硫吡啶、HPDP-生物素等,CAS号为129179-83-5,是实验室及生物制药领域中重要的化学工具试剂。

二、化学分子结构及物理化学特性

Biotin-HPDP的分子结构由三部分核心单元构成:双环生物素环(维生素H核心)、六碳柔性间隔臂(1,6-二氨基己烷),以及末端的巯基反应性基团(3-(2-吡啶二硫)丙酰胺),分子式为C₂₄H₃₇N₅O₃S₃,分子量约为539.78,间隔臂长度约29.2 Å,这种结构设计可减少标记后的位阻效应,提升结合效率。

理化特性方面,该化合物常态下为白色至浅黄色粉末晶体,纯度通常不低于95%;难溶于水,易溶于二甲基亚砜(DMSO)、二甲基甲酰胺(DMF)等有机溶剂,溶解时可适当温和加热辅助;熔点、沸点具有固定范围,储存需在-20℃干燥避光条件下,常温运输即可保持稳定性,避免高浓度还原剂或强酸强碱环境影响其活性。

三、核心优势及使用特点

Biotin-HPDP的核心优势集中在特异性、可逆性和实用性上。其一,特异性极强,仅与生物分子中的游离巯基(-SH)发生反应,不与氨基等其他基团作用,可实现目标分子的精准标记;其二,反应可逆,标记形成的二硫键可被二硫苏糖醇(DTT)等还原剂裂解,释放原始未修饰的生物分子,无需使用强酸等苛刻试剂;其三,膜通透性良好,可穿透细胞膜标记胞内目标分子,适配多种实验场景。

使用上具有便捷性,反应无需金属催化剂,条件温和,在pH 7左右的缓冲体系中反应效果最佳;反应过程可监测,释放的吡啶-2-硫酮在343 nm处有特征紫外吸收峰,可用于追踪反应进度;过量未反应试剂可通过脱盐柱、透析等简单方法去除,降低后续实验干扰。

四、实验原理及反应特性

Biotin-HPDP的核心实验原理是基于巯基-二硫键交换反应:其末端的2-吡啶基二硫基团与目标分子(蛋白质、肽段等)上的游离巯基发生反应,形成稳定的二硫键,同时释放吡啶-2-硫酮;标记后的生物分子可通过生物素与链霉亲和素、抗生物素蛋白的高亲和力结合,实现分离、纯化或检测;后续若需回收目标分子,加入还原剂即可裂解二硫键,恢复其原始结构。

反应过程中需注意,反应缓冲液需不含巯基和二硫化物还原剂,若需还原蛋白质二硫键以暴露巯基,可使用适量DTTTCEP溶液处理后脱盐,避免目标蛋白因过度还原而失活。

五、功能应用及拓展领域

该化合物主要应用于生物化学、分子生物学及相关领域。在蛋白质研究中,可用于标记蛋白质的半胱氨酸残基,实现蛋白质的纯化、检测及相互作用分析;在蛋白组学中,可结合亲和层析富集巯基蛋白,辅助质谱鉴定;在生物传感器与诊断试剂研发中,作为标记试剂提升检测灵敏度。

拓展领域包括细胞分选与成像(标记细胞表面受体)、药物研发(追踪药物与生物分子的结合过程)、S-亚硝基化蛋白检测(生物素开关实验核心试剂)等,是连接化学标记与生物实验的关键工具,广泛服务于科研探索与生物制药研发。


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